Wissenschaftlicher Mitarbeiter im Bereich Bioinformatik (all genders)
Fraunhofer-Gesellschaft – Berlin
Wissenschaftlicher Mitarbeiter im Bereich Bioinformatik (all genders)
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Ort:
Berlin
Datum:
08.07.2026
Die Fraunhofer-Gesellschaft ist eine der weltweit führenden Organisationen für anwendungsorientierte Forschung. 74 Institute entwickeln wegweisende Technologien für unsere Wirtschaft und Gesellschaft – genauer: 30 000 Menschen aus Technik, Wissenschaft, Verwaltung und IT. Sie wissen: Wer zu Fraunhofer kommt, will und kann etwas verändern. Für sich, für uns und die Märkte von heute und morgen.
Das Fraunhofer-Institut für Translationale Medizin und Pharmakologie ITMP am Standort Berlin-Mitte widmet sich der Entwicklung neuer und personalisierter Behandlungsstrategien für Patientinnen und Patienten mit rheumatischen Erkrankungen. Der neue Fraunhofer-Standort wird in enger Zusammenarbeit mit der Charité – Universitätsmedizin Berlin aufgebaut.
Hier sorgen Sie für Veränderung
Sie arbeiten an der Schnittstelle von Bioinformatik, translationaler Medizin und experimenteller Forschung. Unsere Klinik und Forschungsgruppen führen eine Reihe innovativer Studien durch, darunter auch Investigator-Initiated Trials (IITs), mit dem Ziel, neuartige Therapieansätze für rheumatische Erkrankungen zu entwickeln. Hierzu zählen unter anderem CAR-T-Zelltherapien und therapeutische Antikörper zur gezielten Reprogrammierung des Immunsystems. Darüber hinaus analysieren wir große Patientenkohorten mit modernen Multiomik-Verfahren, um Krankheitsmechanismen besser zu verstehen. Ergänzend kommen verschiedene Krankheitsmodelle zum Einsatz, um zelluläre und molekulare Prozesse detailliert zu untersuchen. In Ihrer Rolle unterstützen Sie die Analyse laufender experimenteller Daten und entwickeln innovative Ansätze zur Integration und Interpretation komplexer, mehrdimensionaler Datensätze. Zu Ihren Aufgaben gehören insbesondere:
- computergestützte Analyse von Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatensätzen, insbesondere Single-Cell RNA-Seq und ATAC-Seq
- räumliche Transkriptomik / Multiomik
- Bulk RNA-Seq und ATAC-Seq
- CUT&RUN
- Entwicklung, Implementierung und Optimierung von Bioinformatik-Pipelines
- Integration von Multiomik-Daten mit klinischen und patientenbezogenen Daten
- Mitwirkung bei der Entwicklung neuer computergestützter Ansätze zur Kombination groß angelegter Datensätze
- Enge Zusammenarbeit mit Laborwissenschaftlerinnen, Klinikteams und Bioinformatikerinnen
- Interpretation und Präsentation wissenschaftlicher Ergebnisse in interdisziplinären Teams
- Sicherstellung von Reproduzierbarkeit, Dokumentation und strukturiertem Datenmanagement
Hiermit bringen Sie sich ein
- Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium und Promotion in Biologie, Bioinformatik, Biomedizin oder einer vergleichbaren Fachrichtung
- Fundierte Erfahrung in der Bioinformatik
- Sehr gute Programmierkenntnisse in R und Python
- Nachgewiesene Erfahrung in der Analyse von NGS-Daten
- Praktische Erfahrung in mehreren der folgenden Bereiche:
- Single-Cell-Transkriptomik
- Epigenomik, z. B. ATAC-Seq, CUT&RUN, ChIP-Seq
- räumliche Transkriptomik oder Multiomik
- Erfahrung im Umgang mit großen Datensätzen und Hochleistungsrechnerumgebungen
- Gute Kenntnisse statistischer Methoden zur Analyse hochdimensionaler Daten
- Erfahrung in der Integration unterschiedlicher Datenmodalitäten
- Selbstständige, strukturierte und lösungsorientierte Arbeitsweise
- Sehr gute Deutsch- und Englischkenntnisse
Was wir für Sie bereithalten
- Ein dynamisches und interdisziplinäres Forschungsumfeld
- Eine moderne Forschungseinrichtung mit Zugang zu Spitzentechnologien
- Vielseitige und anspruchsvolle Aufgaben mit hoher wissenschaftlicher Relevanz
- Enge Zusammenarbeit mit Partnern aus universitärer Medizin und translationaler Forschung
- Ein attraktiver Arbeitsplatz in Berlin-Mitte
- Gute Work-Life-Balance durch flexible Arbeitszeitgestaltung mit Gleitzeitmodell
- 30 Tage Urlaub sowie Weihnachten und Silvester als freie Tage
- Persönliche Altersvorsorge (VBL) und weitere (Sozial-)Leistungen des öffentlichen Dienstes, z. B. jährliche Sonderzahlung
- Vermögenswirksame Leistungen
- Zuschuss zum Deutschland-Ticket Jobticket
- Persönliche Entwicklungsmöglichkeiten durch ein vielfältiges Weiterbildungsangebot
- Corporate Benefits: Angebote namhafter Hersteller und Marken
- Ein weites Fraunhofer-Netzwerk
Wir wertschätzen und fördern die Vielfalt der Kompetenzen unserer Mitarbeitenden und begrüßen daher alle Bewerbungen – unabhängig von Alter, Geschlecht, Nationalität, ethnischer und sozialer Herkunft, Religion, Weltanschauung, Behinderung sowie sexueller Orientierung und Identität. Schwerbehinderte Menschen werden bei gleicher Eignung bevorzugt eingestellt. Unsere Aufgaben sind vielfältig und anpassbar – für Bewerber*innen mit Behinderung finden wir gemeinsam Lösungen, die ihre Fähigkeiten optimal fördern.
Die wöchentliche Arbeitszeit beträgt 39 Stunden. Die Stelle ist zunächst bis 31. Dezember 2027 befristet und kann auch in Teilzeit besetzt werden. Anstellung, Vergütung und Sozialleistungen richten sich nach dem Tarifvertrag für den öffentlichen Dienst (TVöD).
Mit ihrer Fokussierung auf zukunftsrelevante Schlüsseltechnologien sowie auf die Verwertung der Ergebnisse in Wirtschaft und Industrie spielt die Fraunhofer-Gesellschaft eine zentrale Rolle im Innovationsprozess. Als Wegweiser und Impulsgeber für innovative Entwicklungen und wissenschaftliche Exzellenz wirkt sie mit an der Gestaltung unserer Gesellschaft und unserer Zukunft.
Bereit für Veränderung? Dann bewerben Sie sich jetzt, und machen Sie einen Unterschied! Nach Eingang Ihrer Online-Bewerbung erhalten Sie eine automatische Empfangsbestätigung. Dann melden wir uns schnellstmöglich und sagen Ihnen, wie es weitergeht.
Fraunhofer-Institut für Translationale Medizin und Pharmakologie ITMP
Kennziffer: 85031
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