Wissenschaftliche:r Mitarbeiter:in (Doktorand:in) (Wissenschaftliche/r Mitarbeiter/in)

Stellenbeschreibung

Wir suchen hochmotivierte Bewerber:innen für das Forschungsprojekt „Phytoplankton-Mikrobiome: Ein Merkmal für Anpassung und polwärts gerichtete Verbreitungsverschiebungen“, das von der Deutschen Forschungsgemeinschaft (DFG) gefördert wird. Dieses Projekt vereint das Fachwissen der Universität Bremen, des Alfred-Wegener-Instituts, Helmholtz-Zentrum für Polar- und Meeresforschung, und des GEOMAR, Helmholtz-Zentrum für Ozeanforschung.

In den verschiedenen Regionen des Südlichen Ozeans (SO) ist Phytoplankton unterschiedlichen Umweltbedingungen ausgesetzt, die wirksame Anpassungsmechanismen erfordern. Wir gehen davon aus, dass die funktionelle Differenzierung und Anpassung von Phytoplankton-Mikrobiomen ein wichtiger Faktor für die ökotypische Differenzierung von Phytoplankton in den SO-Regionen ist. Daher wollen wir die Merkmale und Fähigkeiten des Phytoplanktons aus mikrobiologischer Perspektive charakterisieren und das funktionelle Potenzial des Mikrobioms untersuchen, um Bewältigungsstrategien und die Anpassung des Phytoplanktons an die schwierigen Bedingungen in der Antarktis zu verstehen.

Durch eine Kombination von Laborexperimenten, die die Umweltbedingungen der Antarktis nachbilden, um die gemeinsame Reaktion des Phytoplankton-Wirts und seines Mikrobioms zu beobachten, sowie durch die Analyse von Feldproben aus der Antarktis untersuchen Sie, wie Mikrobiombakterien zur Fitness des Phytoplanktons beitragen. Sie werden Mikroalgen kultivieren und die Dynamik der Mikrobiomgemeinschaft mittels (Einzelwirtszell-)Amplikon-Sequenzierung analysieren, das funktionelle Repertoire des Mikrobioms mittels metagenomischer Sequenzierung und der Konstruktion von metagenomisch assemblierten Genomen (MAGs) analysieren und die Reaktion des Phytoplankton-Wirts mittels RNA-Sequenzierung entschlüsseln.

Ihr Projekt wird unter der Leitung von Prof. Tilmann Harder (Meereschemie) durchgeführt und steht in engem Zusammenhang mit einem mikrobiologischen PostDoc-Projekt (Dr. Jakob Giesler). Sie haben die Möglichkeit, in einer kleinen Forschungsgruppe an Ihrer Promotion zu arbeiten und werden von der Forschungsakademie am MARUM unterstützt. Außerdem können Sie mit nationalen und internationalen Forschungspartnern zusammenarbeiten.

Ihre Aufgaben umfassen im Wesentlichen:

• Kultivierung von marinen Mikroalgen und Bakterien

• Durchführung kontrollierter Wachstumsexperimente unter Laborbedingungen

• Vorbereitung und Analyse molekularer Proben für die Amplikon-Sequenzierung, MetagenomSequenzierung und RNA-Sequenzierung

• Molekulare Analyse von Feldproben (Einzelzellen und Bulk-DNA/RNA)

• Erstellen von wissenschaftlichen Publikationen und Präsentationen

Anforderungen:

• Ein abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master/Diplom) der Fachrichtung (Meeres-)Biologie, Mikrobiologie oder einem verwandten Fachgebiet.

• Es werden auch Bewerber:innen berücksichtigt, die sich in der Abschlussphase des Masterstudiums befinden. Bitte beachten Sie, dass für eine Einstellung die Vorlage des Masterabschlusszeugnisses zwingend erforderlich ist.

• Erfahrung in der Analyse mikrobieller Metagenomdaten

• Fundierte Programmierkenntnisse (z. B. R, bash)

Wünschenswert:

• Großes Interesse an Grundlagenforschung in den Bereichen mikrobielle Ökologie, Phytoplanktonökologie und polare Mikrobiologie

• Hohe Motivation und überdurchschnittliche Qualifikation für die aktive Mitarbeit in einem interdisziplinären Forschungs- und Bildungsumfeld

• Selbstständiges Arbeiten mit Hands-on-Mentalität, Teamgeist, Hilfsbereitschaft und Zuverlässigkeit

• Englischkenntnisse in Word und Schrift (CEF Level mind. B2)