Wissenschaftliche Mitarbeitende (m/w/d) Institut für Medizinische Informatik und Biometrie (Wissenschaftliche/r Mitarbeiter/in)

Universitätsklinikum Carl Gustav Carus Dresden – Dresden

Kurzbeschreibung der Position

Entwicklung einer Analyse-Pipeline für räumliche Einzelzell-Transkriptomdaten (scRNA-seq) und Identifikation molekularer Marker.

Hauptaufgaben

  • Entwicklung einer Analyse-Pipeline für räumliche Einzelzell-Transkriptomdaten (scRNA-seq)
  • Identifikation molekularer Marker und relevanter Zelltypen im Zusammenhang mit der BRAF-Inhibitor-Resistenz von Melanom-Hirnmetastasen
  • Entwicklung eines netzwerkbasierten Analyseansatzes unter Einsatz maschineller Lernverfahren
  • Identifikation Resistenz-assoziierter Gene und zugehöriger zellulärer Regulationsprogramme
  • Durchführung und Auswertung komplexer bioinformatischer Datenanalysen
  • Bereitstellung der Analyseergebnisse als Grundlage für experimentelle Projektpartner
  • Enge Zusammenarbeit mit internationalen Kooperationspartnern
  • Integration der entwickelten Methoden und Ergebnisse in weiterführende Forschungsarbeiten

Qualifikationen und Fähigkeiten

  • abgeschlossenes Hochschulstudium (Bioinformatik, Informatik oder verwandte Disziplin)
  • Promotion im Bereich Bioinformatik / Datenanalyse vorteilhaft
  • solide Erfahrung in der Anwendung und Entwicklung von bioinformatischen Methoden zur Analyse von molekularen Omics-Daten (vorteilhaft: scRNA-seq, spatial scRNA-seq)
  • Programmiererfahrung und sehr gute Kenntnisse der Statistiksoftware R und Python
  • Kenntnisse in den Bereichen Tumorbiologie und maschinelles Lernen sind vorteilhaft
  • Erfahrung bei der Erstellung von Publikationen vorteilhaft
  • Zuverlässigkeit, Kreativität, Flexibilität, Teamfähigkeit
  • kooperativer, eigenverantwortlicher und zielorientierter Arbeitsstil
  • sehr gute Englischkenntnisse und starkes Interesse an interdisziplinären Aufgaben

Arbeitsort / Rahmenbedingungen

  • Vergütung: nach Tarifvertragzzgl. Jahressonderzahlung
  • Urlaub: 30 Tage Erholungsurlaub
  • Weiterbildung: Umfangreiche interne und externe Fort- und Weiterbildungsangebote
  • Jobrad und Zuschuss zum Jobticket
  • Sport- und Bewegungsangebote, Programme zur mentalen Gesundheit
  • Mitarbeiterrabatte und Shoppingportale
  • Unterstützung bei Fragen rund um Kita-Plätze, Ferienprogramme und Pflege von Angehörigen
  • flexible Arbeitsmodelle