Scientist/Postdoc (m/f/d) bioinformatics and data management

Das Universitätsklinikum Schleswig-Holstein (UKSH) verbindet erstklassige internationale Forschung mit interdisziplinärer Patientenversorgung. Wir sind der einzige tertiäre Versorger des Landes und sein größter Arbeitgeber. Unsere rund 17.500 Mitarbeiter gewährleisten eine hochpersonalisierte Versorgung – die für die Menschen in Schleswig-Holstein unverzichtbar ist.

Institut für Klinische Molekularbiologie (IKMB)

Das IKMB sucht zusammen mit der DFG-geförderten Clinical Research Unit (CRU) "CATCH ALL" und der Liquid Biomarkers-Gruppe einen erfahrenen Bioinformatiker mit einem PhD in Bioinformatik, Molekularbiologie, Genetik, Informatik oder einem verwandten Fachbereich zur Verstärkung unserer interdisziplinären Forschungsgruppe. Die Stelle ist am Institut für Klinische Molekularbiologie (IKMB) angesiedelt. Wir laden erfahrene Postdoktoranden ein, die nach zukunftsweisenden Forschungsmöglichkeiten im klinischen Bereich suchen. Diese Position erfordert Expertise in Informatik, Biologie, Omics und Biostatistik. Wir erwarten vom idealen Kandidaten ein intensives Interesse, Drive und Engagement im Hinblick auf unseren Forschungsplan.

Start in unserem Team

Die Stelle ist so bald wie möglich zu besetzen und ist für 47 Monate finanziert, ein idealer Sprungbrett in Ihrer Karriereleiter, um sich auf höhere Positionen vorzubereiten. Der Vertrag wird für 47 Monate befristet abgeschlossen.

Was wir bieten

• Die Vergütung erfolgt auf Basis der deutschen Entgeltgruppe E13 TV-L, sofern die Voraussetzungen des Tarifvertrags erfüllt sind
• Vollzeitbeschäftigung, derzeit 38,5 Stunden pro Woche; Teilzeitbeschäftigung kann im Rahmen bestimmter Arbeitszeitmodelle kompatibel sein
• Viele Mitarbeiterrabatte auf verschiedenen Online-Plattformen und bei verschiedenen Unternehmen
• Hochschulsport und Fitness zu Firmenkonditionen als Ausgleich zur Arbeit
• Weitere attraktive UKSH-Benefits finden Sie hier: Benefits

Was Sie erwarten können

• Integration in die Forschungsagenda, sowohl innerhalb von CATCH ALL als auch innerhalb der Liquid Biomarkers-Gruppe
• Entwicklung und Durchführung originärer Forschungsfragen unter Nutzung unserer einzigartigen Sammlung medizinischer Multi-Omics-Daten
• Verwaltung der vielfältigen Multi-Level-Datensätze in CATCH ALL und Bereitstellung bioinformatischer Lösungen für die damit verbundenen Forschungsfragen
• Datenspeicherung in unserer bestehenden Infrastruktur (iRods und Yoda), Anwendung von Pipelines und Entwicklung neuer bioinformatischer Lösungen
• Möglichkeiten zur Interaktion in EU-Projekten wie Instand-NGS4P und EASIGEN-DS, mit Klinikern und Forschern am Universitätsklinikum Schleswig-Holstein sowie mit externen Forschern national und international

Was Sie mitbringen

• Sicherer Umgang mit der Kommandozeile in Linux, Ausführung von Cluster-Jobs (sbatch, nextflow, snakemake) und mathematisch-statistische Expertise
• Programmiersprachen Bash und Python (einschl. NumPy und Pandas), Umgang mit und Hochladen von Codes auf GitHub
• Professionelle Datenmanagement-Kenntnisse für Next Generation Sequencing (NGS)-Daten und andere wissenschaftliche Datensätze (unter Verwendung von iRods, Yoda) sowie Erfahrung im Einreichen von Daten bei ENA, EGA und anderen entsprechenden Repositorien
• Professionelle Kenntnisse in der Verarbeitung von Omics-Daten (scRNA, RNA, DNA etc.) und Interesse an räumlichen Daten
• Nachgewiesene Fähigkeit und Engagement beim Schreiben und Veröffentlichen hochwertiger wissenschaftlicher Manuskripte

Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung bis zum 26.08.2026 unter Angabe der Stellennummer 29159.