Research data and application specialist for microscopy (f/m/d)

Das Leibniz-Institut für Neurobiologie, Magdeburg (LIN Magdeburg) ist ein Mitglied der Gottfried Wilhelm Leibniz-Gesellschaft (WGL), die 97 Forschungsinstitute in Deutschland vereint. Das LIN Magdeburg verfolgt einen umfassenden interdisziplinären Ansatz zur Untersuchung von Lern- und Gedächtnismechanismen auf verschiedenen Ebenen der Hirnorganisation – von Molekülen über Einzelzellen und lokale Schaltkreise bis hin zu komplexen Netzwerken. Die Untersuchung von Lernen und Gedächtnis auf verschiedenen räumlichen und zeitlichen Ebenen erfordert multimodale Bildgebungstechniken auf verschiedenen Ebenen und erzeugt riesige Mengen hochdimensionaler Daten, deren Komplexität nur durch den Einsatz modernster Informationstechnologie entschlüsselt werden kann.

Für die Implementierung der Forschungs- und Anwendungsplattform „Combinatorial NeuroComputing“ (NeuroCom) und der Microscopy Core Unit suchen wir eine motivierte Person als

Spezialist für Forschungsdaten und Anwendungen in der Mikroskopie (w/m/d)

zunächst befristet bis zum 4. April 2027 zur Elternzeitvertretung. Die Vollzeitstelle mit einer Vergütung nach TV-L E13 ist für den richtigen Kandidaten ab sofort verfügbar.

Das LIN bietet Nutzerzugang und umfassende Schulungen an Fluoreszenz-, Konfokal-, STED- und Lightsheet-Mikroskopen. Neben der Nachbearbeitung und Analyse der gewonnenen Bilddaten besteht die Notwendigkeit einer Implementierung modernster Analyse-Pipelines unter Verwendung bestehender und neuer computergestützter Werkzeuge. Darüber hinaus streben wir eine Verbesserung unserer Forschungsdatenmanagement-Infrastruktur an, die alle Schritte des Forschungsdatenlebenszyklus für die Mikroskopie und die Biobildanalyse umfasst.

Your tasks

• Entwicklung einer Forschungsdatenmanagement-Infrastruktur für die Mikroskopie basierend auf den FAIR-Prinzipien
• Unterstützung wissenschaftlicher Studien unter Verwendung von Fluoreszenz-, Konfokal-, STED- oder Light-Sheet-Mikroskopie (einschließlich Clearing- und Expansionsverfahren) und entsprechender 3D/4D-Bildverarbeitungs- und Analysesoftware
• Beteiligung an der Organisation und Durchführung von Seminaren und Workshops

Your profile:

• Master- oder PhD-Abschluss in Biologie, Bio(medizinischer) Informatik oder computergestützter Biologie oder ein ähnlicher Hintergrund
• praktische Erfahrung in der Anwendung von Konfokal- und Lightsheet-Mikroskopie, professionellen Softwarepaketen zur Biobildverarbeitung und -analyse (z. B. Zeiss Arivis Pro inkl. VR, Imaris) sowie Open-Source-Paketen
• Erfahrung in der Anwendung von Clearing-Protokollen für biologische Proben (z. B. i-Disco, ECi) oder Cubic-basiertem Clearing ist ein Plus
• Erfahrung in der Probenvorbereitung für die Immunhistochemie verschiedener biologischer Proben
• Grundkenntnisse in einer High-Level-Programmiersprache (z. B. Python), Linux-Betriebssystem und Shell-Scripting sind ein Plus
• Fähigkeit zur teamorientierten sowie eigenständigen Arbeit
• exzellente Kommunikationsfähigkeiten, auch in Englisch, um technische Anforderungen klar zu formulieren, klare Ziele zu setzen und in einem interdisziplinären Umfeld zu arbeiten sowie mit Partnern zu kommunizieren
• Leidenschaft für die Schulung neuer Nutzer an verschiedenen Mikroskopiemodalitäten
• Erfahrung und Kenntnisse in STED sind wünschenswert

We offer:

• Ein interessanter und vielseitiger Arbeitsplatz mit einer offenen, einladenden Kultur und einem internationalen, attraktiven Forschungsumfeld
• Campus mit modernster Infrastruktur
• Beschäftigung, Gehalt und Sozialleistungen gemäß dem Tarifvertrag des öffentlichen Dienstes (deutscher TV-L)
• Chancengleichheit und Vereinbarkeit von Beruf und Familienleben
• Flexible Arbeitszeiten und die Möglichkeit zum Homeoffice

Wir schätzen Vielfalt und begrüßen daher alle Bewerbungen – unabhängig von Geschlecht, Nationalität, ethnischer und sozialer Herkunft, Religion, Behinderung, Alter sowie sexueller Orientierung und Identität.

Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung. Bitte senden Sie eine einzelne PDF-Datei, bestehend aus einem kurzen Motivationsschreiben, einem Lebenslauf einschließlich einer Publikationsliste, einer Kopie Ihres letzten akademischen Abschlusses und zwei Empfehlungsschreiben unter Angabe der Referenznummer LIN 2026/10. Bitte beachten Sie, dass wir die Bewerbungen fortlaufend prüfen und dass unvollständige Bewerbungen nicht berücksichtigt werden. Die Prüfung der Bewerbungen beginnt am 16. Juli 2026 und endet, wenn die Stelle besetzt ist.

Wenn Sie einen internationalen Abschluss haben, legen Sie Ihrer Bewerbung bitte auch eine Zeugnisbewertung der Zentralstelle für ausländisches Bildungswesen (ZAB) bei. Wenn Sie noch keine Zeugnisbewertung haben, müssten Sie nach einer erfolgreichen Bewerbung eine beantragen. Weitere Informationen finden Sie auf der Website.

Mit der Einreichung Ihrer Bewerbung willigen Sie in die Verarbeitung Ihrer personenbezogenen Daten zum Zweck des Bewerbungsverfahrens ein. Unsere detaillierte Datenschutzrichtlinie für Bewerber (m/w/d) gemäß Art. 13 DSGVO zur Datenverarbeitung im Bewerbungsverfahren wird auf Anfrage versandt. Wir weisen darauf hin, dass keine Bewerbungs- oder Interviewkosten erstattet werden können. Unterlagen werden nach 6 Monaten gelöscht.