Research Associate (PhD Student) (m/f/d) in Computational Biology / Bioinformatics

Universitätsklinikum Frankfurt – Frankfurt am Main

Unsere Abteilung für Nephrologie und das Else Kroener-Fresenius-Center (EKFZ) bieten exzellente, hochmoderne Einrichtungen für interdisziplinäre und computergestützte Forschung an der Schnittstelle von Nephrologie, Immunologie und kardiovaskulärer Biologie. Wir bieten ein attraktives, unterstützendes Umfeld für moderne Wissenschaft in der Molekularmedizin und Systembiologie. Wir suchen einen ambitionierten, talentierten und hochmotivierten Kandidaten, der unser Team verstärkt.

Das Projekt, an dem Sie arbeiten, ist in ein translationales Forschungsprogramm eingebettet, das darauf abzielt, zu verstehen, wie das hämatopoetische System Interaktionen zwischen Alterung, kardiovaskulären und Nierenerkrankungen vernetzt. Sie werden Multi-Omics-Datensätze integrieren, um molekulare und zelluläre Mechanismen in verschiedenen Organen und Immunzellen zu untersuchen. Durch die Verknüpfung von Einzelzellauflösung mit globalen Biobank-Maßstäben wird Ihre Arbeit dazu beitragen, neue molekulare Mechanismen und therapeutische Ziele zu identifizieren.

Der Kandidat wird von erfahrenen Computerbiologen, Molekularbiologen und Klinikern betreut und unterstützt. Das Projekt ist darauf ausgelegt, Spitzenforschung mit modernsten Methoden und Technologien zu betreiben.

Ihre Rolle

  • Analyse und Integration von internen und öffentlich verfügbaren Single-Cell RNA-seq, Single-Cell ATAC-seq und CITE-seq Datensätzen
  • Analyse groß angelegter genomischer, proteomischer und klinischer Daten aus der UK Biobank (UKB) und dem All of Us Research Program
  • Entwicklung und Implementierung reproduzierbarer und skalierbarer computergestützter Pipelines und Workflows
  • Enger Zusammenarbeit mit Experimentalbiologen und Klinikern in einem interdisziplinären Umfeld, um Hypothesen zu definieren und Ergebnisse in einem biologischen und klinischen Kontext zu interpretieren
  • Präsentation der Forschungsergebnisse innerhalb der Arbeitsgruppe und auf internationalen Konferenzen sowie Publikation in Peer-Review-Fachzeitschriften und Zusammenfassung Ihrer Ergebnisse in einer Doktorarbeit

Ihr Profil

  • Master-Abschluss (oder gleichwertig) in Computational oder Molecular Biology, Bioinformatik, Molekularmedizin oder einem verwandten Bereich
  • Kenntnisse in R oder Python für Datenanalyse, Statistik und Visualisierung
  • Vorerfahrung in der bioinformatischen Analyse von Single-Cell RNAseq (Seurat/Scanpy) und/oder genetischen Daten
  • Ein solides grundlegendes Verständnis der Molekularbiologie, Genetik oder Immunologie und ein starkes Interesse an menschlichen Krankheitsmechanismen
  • Starkes Interesse an der Nutzung von Omics zur Aufklärung von Krankheitsmechanismen bei kardiovaskulären und/oder Nierenerkrankungen und Immunologie
  • Vorerfahrung mit reproduzierbaren Coding-Praktiken und dem Arbeiten in Cloud-Umgebungen ist ein Plus
  • Solides Verständnis der Statistik
  • Bereitschaft, modernste computergestützte Tools und Algorithmen für Single-Cell-, Multi-Omics- und genetische Analysen zu verstehen und anzuwenden
  • Sehr gute verbale und schriftliche Kenntnisse in Englisch; Deutsch ist ein Vorteil, aber nicht erforderlich
  • Hohe Motivation, Fähigkeit zum selbstständigen Arbeiten sowie in einem interdisziplinären Team, exzellente Organisations- und Kommunikationsfähigkeiten
  • Aufgrund gesetzlicher Bestimmungen ist ein gültiger Nachweis über die Immunität gegen Masern / eine Masernimpfung erforderlich

Wir bieten

  • Zusätzlich zu einem attraktiven Gehalt auf Basis eines Tarifvertrags mit einer jährlichen Sonderzahlung profitieren Sie von langfristiger Sicherheit durch betriebliche Altersvorsorgesysteme
  • Interne und externe Schulungen für Ihre berufliche Weiterentwicklung
  • Profitieren Sie von unseren attraktiven Gesundheitsangeboten. Wir bieten regelmäßige Online- und Präsenzkurse zu Ernährung, Entspannung, Sport und Bewegung an
  • Wir bieten Kinderbetreuung in unserer Kindertagesstätte (bei Fragen wenden Sie sich bitte an den UKF-Familienservice), Kinderbetreuung während der Ferien
  • Kostenloser öffentlicher Nahverkehr in ganz Hessen (Freistautticket Hessen)
  • Uniklinik-Campus, Mensa, Cafés
  • Einblicke: Instagram, YouTube, LinkedIn
  • FAQs für neue Mitarbeiter

Es ist Zeit, unserem Team beizutreten!

Wir freuen uns auf Ihre vollständige Bewerbung, einschließlich Ihres Lebenslaufs, eines Motivationsschreibens sowie Ihrer relevanten Zeugnisse und Referenzen.

Wir begrüßen Bewerbungen von Kandidaten aller Geschlechter. Frauen sind derzeit in diesen Positionen an der Universitätsmedizin Frankfurt unterrepräsentiert. Daher werden Bewerbungen von Frauen besonders ermutigt. Bewerber mit schweren Behinderungen werden bei gleicher persönlicher und fachlicher Qualifikation bevorzugt berücksichtigt.