Postdoctoral researcher for multimodal omics integration and analysis (m/w/d) (Wissenschaftliche/r Mitarbeiter/in)

Kurzbeschreibung der Position

Wir suchen einen hochmotivierten Postdoktoranden für die Integration und Analyse multimodaler Omik-Daten, der unser wachsendes Team im Spitzer-Labor verstärkt.

Hauptaufgaben

• Durchführung fortgeschrittener Einzelzell- und räumlicher Omik-Analysen
• Entwicklung von Methoden zur (räumlichen) Multi-Omik-Datenintegration
• Anpassung und Optimierung von Analyse-Workflows für verschiedene biologische und krankheitsspezifische Kontexte
• Beitrag zur Entwicklung gemeinsamer Tools, Pipelines und reproduzierbarer Workflows
• Unterstützung und Beratung von Kooperationsprojekten innerhalb des CRC

• Repräsentationslernen für ungepaarte multimodale Daten
• Räumliche Modellierung und Zell-Zell-Interaktionsanalyse
• Integration von Omik-Daten mit Bilddaten

Qualifikationen und Fähigkeiten

• Promotion in Computational Biology, Bioinformatik, Informatik, Mathematik oder einem verwandten quantitativen Fachgebiet
• Starkes Interesse an Neurowissenschaften und der Anwendung von Datenanalyse und maschinellem Lernen zur Untersuchung von Krankheitsmechanismen oder zur Verbesserung diagnostischer Verfahren
• Erfahrung mit (räumlicher) Omik-Analyse (z.B. scRNAseq, Proteomik, Visium, MERFISH); Erfahrung mit histologischer Datenanalyse ist ein Plus
• Solides Verständnis von maschinellem Lernen oder statistischer Modellierung; Erfahrung mit angewandtem ML/DL ist ein Plus
• Starke Programmierkenntnisse in Python und/oder R
• Vertrautheit mit Linux und HPC-Systemen
• Teamfähigkeit, Eigeninitiative und die Bereitschaft, in interdisziplinären Teams zu arbeiten

Arbeitsort / Rahmenbedingungen

Wir bieten ein hochkollaboratives und inspirierendes Forschungsumfeld. Das Labor befindet sich im brandneuen Center for Stroke and Dementia Research (CSD) mit Zugang zu modernsten Technologien in Genomik, Proteomik, Metabolomik, Immunologie, Molekularbiologie, Bildgebung (von Nano- bis Makro-Skala) und Neurowissenschaften im Allgemeinen.

Wir sind eingebettet in die lebendige biomedizinische und Data-Science-Forschungslandschaft in München und assoziiert mit dem Computational Health Center in Helmholtz Munich, was zahlreiche Möglichkeiten für lokale und internationale Kooperationen bietet.

Wir sind auch Teil des Münchner Clusters für Systemneurologie (SyNergy), der ein vielfältiges und integratives Umfeld mit umfassender Unterstützung für Neuankömmlinge bietet, einschließlich Initiativen zur Gleichstellung der Geschlechter, Mentoring, Reiseförderungen, Postdoc-Auszeichnungen und familiärer Unterstützung.

Die Vergütung richtet sich nach dem Tarifvertrag für den öffentlichen Dienst der Länder (TV-L) einschließlich aller im öffentlichen Dienst üblichen Zulagen. Die Position ist zunächst auf 2 Jahre befristet mit der Möglichkeit einer Verlängerung.