PostDoc (f/d/m) Project "MALDIDive"

Med. Hochschule Hannover – Hannover

Über uns

Die Medizinische Hochschule Hannover (MHH), mit rund 10.000 Beschäftigten größter Landesbetrieb des Landes Niedersachsen, ist eine universitäre Einrichtung für Forschung und Lehre in der Human- und Zahnmedizin und ein Universitätsklinikum der Supramaximalversorgung. Forschung, Lehre, Krankenversorgung und Administration arbeiten im Integrationsmodell auf dem MHH-Campus Hand in Hand.

Das Peter L. Reichertz Institute for Medical Informatics (PLRI) ist eines der größten universitären Zentren für medizinische Informatik in Deutschland. Es gehört zu zwei führenden Universitäten, liegt in einer der forschungsintensivsten Regionen Europas und bietet exzellente Forschungsmöglichkeiten. In interdisziplinären Projekten arbeitet das PLRI mit Gesundheitszentren, Forschungsinstituten, Unternehmen und öffentlichen Einrichtungen zusammen, um die Zukunft des Gesundheitssystems und der Medizin zu gestalten. Die Aktivitäten reichen von vielfältigen Themen auf lokaler Ebene bis hin zu regionalen, nationalen und globalen Kooperationen.

Die Forschungsgruppe „Clinical Data Science“ konzentriert sich auf die Entdeckung neuartiger klinischer und -omics-Biomarker für die Krankheitsdiagnose und -prognose, um die Patientenbehandlung zu personalisieren und somit zu verbessern. Zu diesem Zweck integrieren wir phänotypische Informationen sowie routinemäßige klinische und (Multi-)Omics-Daten durch hochdimensionale Statistik und modernste künstliche Intelligenz, um neue Einblicke in zugrunde liegende Krankheitsmechanismen zu gewinnen. Darüber hinaus sind wir an der Entwicklung und Implementierung von Forschungsdatenplattformen für komplexe (Multi-)Omics-Daten interessiert. Das Projekt „MALDIDive: Enabling AI Research with Public MALDI-TOF Fingerprints across Microbial Diversity“, das innerhalb eines interdisziplinären Forschungsteams durchgeführt und von der Deutschen Forschungsgemeinschaft gefördert wird, wird eine gut kuratierte Datenplattform für MALDI-TOF-Massenspektrometrie-Datensätze von der Leibniz-Institut DSMZ (Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH) aufbauen. Wir suchen eine/n begeisterte/n PostDoc, der/die an der Entwicklung und Bereitstellung von Omics-Datenplattformen für zukünftige KI-Anwendungen interessiert ist.

Ihre Aufgaben

  • Datenplattform-Architektur, Backend- und Frontend-Entwicklung sowie Bereitstellung für MALDI-TOF-Massenspektrometrie-Datenbank/Plattform und zugehörige Metadaten
  • Entwicklung interaktiver Datenvisualisierungskonzepte und deren Implementierung in die Datenplattform
  • Entwicklung und Realisierung von kurzen Erklärvideos für Plattformnutzer
  • Co-Organisation und Co-Leitung von Stakeholder-Workshops zur Definition von Nutzeranforderungen und Durchführung von Nutzertestzyklen
  • Präsentation vor der wissenschaftlichen Gemeinschaft, d.h. durch Veröffentlichungen in hochrangigen Fachzeitschriften und durch Präsentationen auf internationalen Konferenzen
  • Enge Zusammenarbeit mit interdisziplinären Projektpartnern aus den Bereichen KI/Data Science, analytische und mikrobiologische Forschung, insbesondere der DSMZ
  • Betreuung von Bachelor-/Masterstudierenden

Ihr Profil

  • Promotion / Dr. rer. nat. / Dr.-Ing. in Data Science / Bioinformatik / Computational Biology / Informatik / Physik oder ähnlichen Forschungsbereichen
  • Expertise in der Arbeit mit Datenbanken, interaktiver Plattformentwicklung, Omics- und biomedizinischen Daten und/oder künstlicher Intelligenz / maschinellem Lernen
  • Beherrschung der Backend-/Frontend-Entwicklung und/oder Datenbankprogrammierung, einschließlich einer oder mehrerer der folgenden Programmiersprachen: VueJS, TypeScript, SQL, PYTHON, R Shiny, nginx, Docker, etc.
  • Sehr gute Englischkenntnisse (schriftlich und mündlich)
  • Wünschenswert: Erfahrung mit Code-Dokumentationssystemen und RestAPI
  • Wünschenswert: Kenntnisse der deutschen Sprache

Wir bieten

  • Eine Vollzeitstelle, zunächst befristet auf zwei Jahre mit 38,5 Stunden pro Woche bei einem der größten Arbeitgeber des Landes Niedersachsen
  • Je nach individueller Qualifikation ist eine Vergütung nach TV-L Entgeltgruppe E13 mit den Vorteilen des öffentlichen Dienstes (z. B. betriebliche Altersvorsorge und Zusatzversicherung über die VBL) möglich
  • Eine spannende Rolle an der Schnittstelle von Forschung, Gesundheitswesen und Wissenschaftsmanagement
  • Eine unterstützende Einarbeitung in einem motivierten und interdisziplinären Team
  • Unterstützung bei der Weiterverfolgung der Postdoc-Karriere (z. B. Mentoring-Programme etc.)
  • Arbeit in einem hochmotivierten und kooperativen Forschungsteam von Wissenschaftlern
  • Exzellente Perspektiven für Ihre wissenschaftliche Karriereentwicklung und Vernetzung
  • Individuelle Schulungs- und Weiterbildungsmöglichkeiten
  • Ein umfassendes betriebliches Gesundheitsmanagement – denn Ihre Gesundheit liegt uns am Herzen