PhD Student (m/f/d) Multi-Omics Biomarker Discovery and Transcriptomics

Das Universitätsklinikum Schleswig-Holstein (UKSH) verbindet internationale Spitzenforschung mit interdisziplinärer Krankenversorgung. Wir sind einziger Maximalversorger und größter Arbeitgeber des Landes. Unsere rund 17.000 Mitarbeitenden stellen eine höchst individuelle Versorgung sicher - unverzichtbar für die Menschen in Schleswig-Holstein.

Institute of Clinical Molecular Biology

Das Institut für Klinische Molekularbiologie konzentriert sich auf das Verständnis der Pathophysiologie chronisch entzündlicher Erkrankungen, insbesondere chronisch entzündlicher Darmerkrankungen (CED), und hat kürzlich zum molekularen Verständnis beigetragen, wie CED-Risikogene in eine chronische Darmentzündung beim Menschen übergehen. Das Institut ist eines der Kernforschungszentren in verschiedenen nationalen und internationalen Forschungsallianzen (z. B. DFG ExC, IMI2 3TR und ImmUniverse).

Starten Sie in unserem Team

Wir suchen zum nächstmöglichen Zeitpunkt professionelle und kompetente Unterstützung. Der erste Vertrag ist auf drei Jahre befristet, mit der Absicht einer Verlängerung.

Was wir bieten:

• Die Vergütung erfolgt nach der deutschen Entgelttabelle E13 TV-L (65%), sofern die Voraussetzungen des Tarifvertrags erfüllt sind
• Die Möglichkeit, in einem hochinterdisziplinären und internationalen Umfeld zu promovieren
• Zugang zu einzigartigen, groß angelegten klinischen und Multi-Omics-Datensätzen aus CED-Kohorten
• Fortbildungsmöglichkeiten in fortgeschrittener Bioinformatik, Systemimmunologie und Mikrobiomforschung
• Ein stimulierendes und unterstützendes wissenschaftliches Umfeld mit engmaschiger Betreuung und Mentoring

Ihre Aufgaben:

• Biomarker-Entdeckung unter Verwendung von Bulk-Transkriptomik-Daten aus Blut- und Gewebeproben
• Analyse von groß angelegten longitudinalen Genexpressions-Datensätzen
• Identifizierung dynamischer molekularer und epigenetischer Signaturen im Zusammenhang mit dem Fortschreiten der Krankheit und dem Ansprechen auf die Behandlung
• Unterstützung bei der Patientenstratifizierung und datengesteuerten klinischen Entscheidungsfindung
• Identifizierung neuer therapeutischer Ziele, einschließlich PROTAC-basierter Ansätze

Ihr Profil:

• Ein abgeschlossenes akademisches Studium (Master oder gleichwertig) in Bioinformatik, computergestützter Biologie, Systembiologie, Biostatistik, Ingenieurwesen, Mathematik oder verwandten Bereichen
• Erfahrung in der Bioinformatik und der Analyse verschiedener Omics-Datenschichten ist willkommen; spezifische Kenntnisse in der Transkriptomanalyse, einschließlich Differenzial- und Koexpressionsanalysen, sind ein Plus
• Programmier- und Datenanalysekenntnisse sind von Vorteil (R und/oder Python; Erfahrung mit HPC-Umgebungen)
• Begeisterung für die Integration von Multi-Omics-Daten und systemmedizinische Ansätze
• Exzellente englische Kommunikations- und Schreibfähigkeiten

Bitte reichen Sie Ihre Bewerbung bis zum 11.05.2026 unter Angabe der Referenznummer 28362 ein.