PhD Student (m/f/d) Microbiome Research in Chronic Inflammatory Diseases (Wissenschaftliche/r Mitarbeiter/in)

Universitätsklinikum Schleswig-Holstein – Kiel

Kurzbeschreibung der Position

Das Universitätsklinikum Schleswig-Holstein (UKSH) verbindet internationale Spitzenforschung mit interdisziplinärer Krankenversorgung. Das Institut für Klinische Molekularbiologie konzentriert sich auf das Verständnis der Pathophysiologie chronisch-entzündlicher Erkrankungen, insbesondere entzündlicher Darmerkrankungen, und hat in jüngster Zeit zum molekularen Verständnis beigetragen, wie IBD-Risikogene zu chronischen Entzündungen des Darms beim Menschen führen.

Hauptaufgaben

  • Arbeit an Projekten, die sich auf die Rolle des Darmmikrobioms bei entzündlichen Darmerkrankungen (IBD) konzentrieren.
  • Integration von Multi-Omics-Datensätzen, um Mechanismen zu entschlüsseln, die dem Krankheitsverlauf und dem Therapieansprechen zugrunde liegen.
  • Arbeit mit mehrschichtigen OMICS-Datensätzen.
  • Verstehen, wie mikrobielle Gemeinschaften und ihr funktionelles Potenzial die Immunregulation beeinflussen und therapeutische Ergebnisse beeinflussen.

Qualifikationen und Fähigkeiten

  • Abgeschlossener Hochschulabschluss (Master oder gleichwertig) in Ingenieurwesen, Mathematik, Bioinformatik, Computational Biology, Systems Biology, Biostatistik oder verwandten Bereichen.
  • Erfahrung in der Bioinformatik und Analyse verschiedener Omics-Datenschichten ist willkommen. Spezifische Kenntnisse in der Mikrobiomanalyse, einschließlich MAG-Rekonstruktion und 16S-Datenanalyse, sind von Vorteil.
  • Programmier- und Datenanalysekenntnisse sind von Vorteil (R und/oder Python; Erfahrung mit HPC-Umgebungen).
  • Begeisterung für die Integration von Multi-Omics-Daten und Systemmedizin-Ansätze.
  • Ausgezeichnete Englischkenntnisse in Wort und Schrift.

Arbeitsort / Rahmenbedingungen

  • Die Stelle ist ab dem 01.06.2026 zu besetzen.
  • Der anfängliche Vertrag ist auf drei Jahre befristet mit der Absicht, ihn zu verlängern.
  • Möglichkeit zur Promotion in einem hochinterdisziplinären und internationalen Umfeld.
  • Zugang zu einzigartigen, groß angelegten klinischen und Multi-Omics-Datensätzen aus IBD-Kohorten.
  • Schulungsmöglichkeiten in fortgeschrittener Bioinformatik, Systemimmunologie und Mikrobiomforschung.
  • Ein anregendes und unterstützendes wissenschaftliches Umfeld mit enger Betreuung und Mentoring.