Bioinformatiker (m/w/d)

Aufgaben

• Durchführung mikrobiologischer und molekularbiologischer Laborarbeiten an Umwelt- und pflanzenassoziierten Proben (z. B. Kultivierung, DNA- / RNA-Extraktion, PCR, Bibliotheksvorbereitung für Amplikon- / Metabarcoding-Sequenzierung)
• bioinformatische Prozessierung und Qualitätskontrolle von Sequenzierdaten (z. B. Amplikon- / Metabarcoding-Pipelines)
• Entwicklung und Anwendung fortgeschrittener statistischer Modelle zur Analyse von Mikrobiom-, ökologischen und experimentellen Datensätzen
• Durchführung grundlegender Feldprobenahmen (z. B. Boden-, Pflanzen- und Rhizosphärenproben) zur Unterstützung der Feldexperimente der Gruppe
• Erstellung von R-basierten Skripten und Workflows für Datenverarbeitung, statistische Analyse und Visualisierung
• Mitbetreuung von Bachelor- und Masterstudierenden
• Verfassen wissenschaftlicher Publikationen in internationalen Fachzeitschriften mit Peer-Review und Präsentation der Ergebnisse auf Konferenzen

Profil

• eine abgeschlossene Promotion in mikrobieller Ökologie, Bioinformatik oder einem verwandten naturwissenschaftlichem Fach
• praktische Erfahrung mit molekularbiologischen Labortechniken (Kultivierung, DNA- / RNA-Extraktion, PCR, Bibliotheksvorbereitung für die Sequenzierung)
• fundierte bioinformatische Kenntnisse, einschließlich Erfahrung in der Verarbeitung und Analyse von Hochdurchsatz-Sequenzierdaten (z. B. Amplikon- / Metabarcoding-Pipelines wie dada2 oder QIIME)
• fortgeschrittene Programmierkenntnisse in R, einschließlich Datenaufbereitung, Visualisierung und reproduzierbarer Workflows
• fortgeschrittene Kompetenz in statistischer Modellierung und Analyse (z. B. gemischte Modelle, multivariate Statistik)
• Bereitschaft und Fähigkeit zur Durchführung grundlegender Feldarbeiten
• verhandlungssichere englische Sprachkenntnisse; Kenntnisse der deutschen Sprache sind von Vorteil
• eine offene, flexible und positive Person, die in einem Team arbeiten kann, aber auch in der Lage ist, die Initiative zu ergreifen
• Bereitschaft zu Dienstreisen, daher ist eine Fahrerlaubnis der Klasse B (Pkw) von Vorteil

Wir bieten

• einen attraktiven Arbeitsplatz an einem modernen Forschungsinstitut für Gartenbauwissenschaften
• ein engagiertes und kompetentes Team und eine anspruchsvolle Tätigkeit, die molekulare, bioinformatische, statistische und feldbasierte pflanzenwissenschaftliche Forschung miteinander verbindet
• flexible und familiengerechte Arbeitszeitmodelle und die Möglichkeit des mobilen Arbeitens (bis zu 50 % der Arbeitszeit)
• VBL Ost-betriebliche Altersvorsorge im öffentlichen Dienst sowie tarifliche Jahressonderzahlung und 30 Tage Urlaub pro Jahr
• Zuschuss zum Firmenticket für den öffentlichen Nahve

Rahmenbedingungen

Am Institut ist ab dem 01.02.2027, befristet für zwei Jahre, in der Forschungsgruppe „System Pflanze-Mikroorganismen“ folgende Stelle zu besetzen: Wissenschaftlicher Mitarbeiterin (w/m/d) im Bereich Mikrobielle Ökologie und Bioinformatik Kennziffer: 17/2026/2 Die Vergütung erfolgt entsprechend der Qualifikation und Erfahrung nach dem Tarifvertrag TV-L, bis zur Entgeltgruppe 13, Vollzeit. Die Stelle ist teilzeitgeeignet.

Über das Leibniz-Institut für Gartenbauwissenschaften (IGZ)

Das Leibniz-Institut für Gartenbauwissenschaften (IGZ) betreibt exzellente pflanzenwissenschaftliche Grundlagenforschung für die Anwendung im Gartenbau mit Schwerpunkt Gemüse und der Nutzung pflanzlicher Diversität. Das IGZ ist Teil der Leibniz-Gemeinschaft und hat seinen Sitz in Großbeeren.

Bewerbung

Homeoffice: Umfang: Nach Vereinbarung