Bioinformatik promovierenden Wissenschaftler (w/m/d)

Bioinformatik promovierenden Wissenschaftler (w/m/d)

Forschungszentrum Borstel, Leibniz Lungenzentrum (FZB), Borstel

Bioinformatik promovierenden Wissenschaftler (w/m/d)

Wir suchen zum nächstmöglichen Zeitpunkt einen in

Bioinformatik promovierenden Wissenschaftler (w/m/d)

für den Leibniz WissenschaftsCampus„Antimicrobial Resistance Plasticity (AMR-PLAS)“.

Die Stelle ist zunächst für 3 Jahre befristet (65% TVöD).

Das Forschungszentrum Borstel ist das Lungenzentrum in der Leibniz Gemeinschaft. Wir sind ein international agierendes, von Bund und Ländern finanziertes Wissenschaftsunternehmen. Unsere zentrale Aufgabe ist die Grundlagen- und translationale Forschung auf dem Gebiet der Atemwegserkrankungen. Wir betreiben umfangreiche Labor- und Forschungsinfrastrukturen. Akademisch sind wir mit den benachbarten Universitäten und klinisch mit dem Universitätsklinikum Schleswig-Holstein eng verbunden. Wir haben ein Ziel: Bestehende Methoden zur Erkennung, Vermeidung und Behandlung von Lungenerkrankungen zu verbessern und neue, innovative Therapieansätze zu entwickeln.

Ihre Aufgaben:

Im Leibniz ScienceCampus AMR-PLAS wird untersucht, wie sich Mikroorganismen unter Antibiotikabehandlung anpassen, um die Plastizität von Bakterien besser zu verstehen und ein tieferes Verständnis der Entstehung antimikrobieller Resistenzen (AMR) zu erhalten. Die weltweite Ausbreitung von AMR führt zu einer Zunahme schwer behandelbarer Infektionen und stellt insbesondere bei Erkrankungen wie Tuberkulose eine große Herausforderung dar. Im AMR-PLAS erforschen wir genomische und nicht-genomische Mechanismen bakterieller Plastizität bei klinisch relevanten Pathogenen, darunter ESKAPE-Erreger und Mykobakterien. Als Doktorand*in werden Sie Teil des Leibniz ScienceCampus AMR-PLAS mit sieben Promovierenden am Forschungszentrum Borstel und der Christian-Albrechts-Universität zu Kiel. Sie arbeiten eng mit einer Juniorwissenschaftlerin bzw. einem Juniorwissenschaftler zusammen und profitieren von strukturierter Ausbildung, methodischer Betreuung und kontinuierlichem wissenschaftlichem Austausch. Der Leibniz ScienceCampus ist ein regionales Netzwerk der Leibniz-Gemeinschaft, das Universitäten und außeruniversitäre Forschungseinrichtungen zu einem gemeinsamen Thema verbindet. Er fördert interdisziplinäre Zusammenarbeit, strukturierte Promotionsprogramme, Vernetzung im wissenschaftlichen Nachwuchs sowie den Transfer von Forschung in die Praxis. Die beteiligten Gruppen bieten ein international wettbewerbsfähiges Forschungsumfeld mit modernster Ausstattung und arbeiten mit experimentellen, molekularbiologischen, genomischen und theoretischen Ansätzen.

Ihre Kompetenzen:

• Abgeschlossenes Masterstudium (oder gleichwertig) in Bioinformatik, oder in Informatik, Data Science, Statistik, etc. mit Bezug zur Molekularbiologie
• Ausgeprägte quantitative und analytische Fähigkeiten sowie Interesse an mikrobieller Genomik und Wirt-Pathogen-Interaktionen
• Grundkenntnisse und großes Interesse an der Analyse von Next-Generation-Sequencing-(NGS)-Daten
• Erfahrung in mindestens einer Programmiersprache, vorzugsweise Python und/oder R; routinierter Umgang mit der Linux-Kommandozeile
• Erfahrung mit Linux-basierten Umgebungen; Kenntnisse im High-Performance Computing (HPC) sind von Vorteil
• Erfahrung mit Workflow-Management-Systemen (z. B. Snakemake oder Nextflow) oder die Bereitschaft, diese zu erlernen
• Begeisterung für interdisziplinäre Forschung sowie die Bereitschaft, Wissen über Fachgrenzen hinweg zu erwerben
• Erste Erfahrungen in interdisziplinärer Zusammenarbeit sind von Vorteil
• Selbstständige und strukturierte Arbeitsweise sowie die Fähigkeit, Projekte eigenverantwortlich voranzubringen und gleichzeitig erfolgreich im Team zu arbeiten

Unser Angebot:

• Arbeiten in einem renommierten Lungenforschungszentrum vor den Toren Hamburgs
• Ein eigenverantwortlicher Arbeitsbereich innerhalb eines motivierten Teams
• Vergütung nach dem TVöD-VKA einschließlich aller im öffentlichen Dienst üblichen Leistungen
• Familienfreundliche Arbeitsbedingungen und flexible Arbeitszeiten; Betriebliche Gesundheitsförderung