Bioinformatics staff scientist (all genders)

Die Fraunhofer-Gesellschaft ist eine der weltweit führenden Organisationen für anwendungsorientierte Forschung. 74 Institute entwickeln wegweisende Technologien für unsere Wirtschaft und Gesellschaft – genauer gesagt: 30.000 Menschen aus den Bereichen Technik, Wissenschaft, Verwaltung und IT. Sie wissen: Wer zu Fraunhofer kommt, will und kann etwas bewegen. Für sich selbst, für uns und für die Märkte von heute und morgen.

Das Fraunhofer-Institut für Translationale Medizin und Pharmakologie ITMP in Berlin-Mitte konzentriert sich auf die Entwicklung neuer und personalisierter Behandlungsstrategien für Patienten mit rheumatischen Erkrankungen. Dieser neue Fraunhofer-Standort wird in enger Zusammenarbeit mit der Charité – Universitätsmedizin Berlin aufgebaut.

Teil des Wandels sein

Sie werden an der Schnittstelle von Bioinformatik, translationaler Medizin und experimenteller Forschung arbeiten. Unsere klinischen und Forschungsteams führen eine breite Palette innovativer Studien durch, darunter Investigator-Initiated Trials (IITs), mit dem Ziel, neuartige therapeutische Ansätze für rheumatische Erkrankungen zu entwickeln. Dazu gehören unter anderem der Einsatz von CAR-T-Zell-Therapien und therapeutischen Antikörpern zur Reprogrammierung des Immunsystems. Darüber hinaus führen wir groß angelegte Multi-Omics-Analysen von Patientenkohorten durch, um tiefere Einblicke in die Pathologie der Erkrankungen zu gewinnen. Wir setzen zudem eine Reihe von Krankheitsmodellen ein, um spezifische zelluläre und molekulare Mechanismen im Detail zu untersuchen. In dieser Rolle unterstützen Sie die Analyse laufender experimenteller Datensätze und treiben gleichzeitig innovative Ansätze für die Integration und Interpretation komplexer, multidimensionaler Daten voran. Ihre Aufgaben umfassen insbesondere:

• Durchführung computergestützter Analysen von High-Throughput-Sequenzierungsdatensätzen, einschließlich:
• Single-Cell RNA-Seq und ATAC-Seq
• Räumliche Transkriptomik / räumliche Multi-Omics
• Bulk RNA-Seq und ATAC-Seq
• CUT&RUN
• Entwicklung, Implementierung und Optimierung von Bioinformatik-Pipelines zur Datenverarbeitung und -analyse
• Integration von Multi-Omics-Datensätzen mit klinischen und patientenbezogenen Daten
• Mitwirkung an der Entwicklung neuartiger computergestützter Ansätze zur Kombination groß angelegter Datensätze
• Enge Zusammenarbeit mit Laborwissenschaftlern, Klinikern und anderen Bioinformatikern
• Interpretation und Präsentation von Ergebnissen gegenüber multidisziplinären Teams
• Sicherstellung der Reproduzierbarkeit, ordnungsgemäßen Dokumentation und fundierter Datenmanagementpraktiken

Was Sie beitragen

• Ein abgeschlossenes PhD-Studium in Biologie, Bioinformatik, Biomedizin oder einer verwandten lebenswissenschaftlichen Disziplin
• Fundierte praktische Erfahrung in der Bioinformatik
• Exzellente Programmierkenntnisse in R und Python
• Nachgewiesene Erfahrung in der Analyse von Next-Generation-Sequencing (NGS)-Daten
• Praktische Erfahrung in mehreren der folgenden Bereiche:
• Single-Cell-Transkriptomik
• Epigenomik, z. B. ATAC-Seq, CUT&RUN, ChIP-Seq
• Räumliche Transkriptomik oder Multi-Omics
• Erfahrung im Umgang mit groß angelegten Datensätzen und im Arbeiten in High-Performance-Computing-Umgebungen
• Solide Kenntnisse statistischer Methoden zur Analyse hochdimensionaler Daten
• Erfahrung mit integrativen Analysen über mehrere Datenmodalitäten hinweg
• Starke Problemlösungsfähigkeiten und die Fähigkeit, unabhängig zu arbeiten
• Fließende Kenntnisse in Deutsch und Englisch

Was wir bieten

• Ein dynamisches und interdisziplinäres Forschungsumfeld
• Eine moderne Forschungseinrichtung mit Zugang zu Spitzentechnologien
• Vielfältige und anspruchsvolle Aufgaben mit hoher wissenschaftlicher Relevanz
• Enge Zusammenarbeit mit Partnern in der akademischen Medizin und translationalen Forschung
• Ein attraktiver Arbeitsplatz im Herzen Berlins
• Eine gute Work-Life-Balance durch flexible Arbeitszeiten und ein Gleitzeitmodell
• 30 Tage Jahresurlaub sowie den 24. und 31. Dezember frei
• Eine betriebliche Altersversorgung (VBL) und weitere öffentlich-rechtliche Sozialleistungen, einschließlich einer jährlichen Sonderzahlung
• Vermögenswirksame Leistungen
• Ein Zuschuss zum Deutschlandticket als Jobticket
• Möglichkeiten zur persönlichen und beruflichen Weiterentwicklung durch ein breites Angebot an Schulungsprogrammen
• Corporate Benefits mit attraktiven Angeboten bekannter Marken und Hersteller
• Zugang zum umfassenden professionellen und wissenschaftlichen Netzwerk von Fraunhofer

Die wöchentliche Arbeitszeit beträgt 39 Stunden. Die Stelle ist zunächst bis zum 31. Dezember 2027 befristet und kann auch in Teilzeit besetzt werden. Wir schätzen und fördern die Vielfalt der Fähigkeiten unserer Mitarbeitenden und begrüßen daher alle Bewerbungen – unabhängig von Alter, Geschlecht, Nationalität, ethnischer und sozialer Herkunft, Religion, Ideologie, Behinderung, sexueller Orientierung und Identität. Schwerbehinderte Menschen werden bei gleicher Eignung bevorzugt berücksichtigt. Unsere Aufgaben sind vielfältig und anpassungsfähig – bei Bewerbern mit Behinderungen arbeiten wir gemeinsam an Lösungen, die ihre Fähigkeiten bestmöglich fördern. Einstellung, Vergütung und soziale Leistungen richten sich nach dem Tarifvertrag für den öffentlichen Dienst (TVöD).

Mit seinem Fokus auf die Entwicklung von Schlüsseltechnologien, die für die Zukunft entscheidend sind, und der Ermöglichung der kommerziellen Nutzung dieser Arbeit durch Wirtschaft und Industrie, spielt Fraunhofer eine zentrale Rolle im Innovationsprozess. Als Pionier und Katalysator für bahnbrechende Entwicklungen und wissenschaftliche Exzellenz hilft Fraunhofer, die Gesellschaft heute und in Zukunft zu gestalten.

Bereit für eine Veränderung? Dann bewerben Sie sich jetzt und bewirken Sie etwas! Sobald wir Ihre Online-Bewerbung erhalten haben, erhalten Sie eine automatische Eingangsbestätigung. Wir werden uns dann so schnell wie möglich bei Ihnen melden und Sie über die nächsten Schritte informieren.

Fraunhofer-Institut für Translationale Medizin und Pharmakologie ITMP