Bioinformatician (m/f/d)

Bioinformatician (m/f/d)

Über die Rolle

Wir suchen einen hochmotivierten und qualifizierten Bioinformatiker für unsere Abteilung für Rheumatologie. Diese Rolle bietet eine spannende Gelegenheit, an der Schnittstelle zwischen computergestützter Biologie und translationaler Medizin zu arbeiten und zu wegweisender Forschung über rheumatische Erkrankungen beizutragen.

Hauptaufgaben

• Durchführung computergestützter Analysen von High-Throughput-Sequenzierungsdatensätzen, einschließlich:
• Einzelzell-RNA- und ATAC-Sequenzierung
• Räumliche Multiomik/Transkriptomik (Xenium und ähnliche)
• Bulk-RNA- und ATAC-seq
• CUT&RUN
• NULISA
• Entwicklung, Implementierung und Optimierung von Bioinformatik-Pipelines für die Datenverarbeitung und -analyse
• Integration von Multi-Omik-Datensätzen mit klinischen und patientenbezogenen Daten
• Beitrag zur Entwicklung neuartiger computergestützter Ansätze zur Kombination großflächiger Datensätze
• Enge Zusammenarbeit mit Wet-Lab-Wissenschaftlern, Klinikern und anderen computergestützten Forschern
• Interpretation und Präsentation der Ergebnisse gegenüber multidisziplinären Teams
• Sicherstellung von Reproduzierbarkeit, Dokumentation und ordnungsgemäßen Datenmanagementpraktiken

Erforderliche Qualifikationen & Fähigkeiten

• PhD oder MSc in Bioinformatik, computergestützter Biologie, Genomik oder einem verwandten Bereich
• Starke Programmierkenntnisse in R und Python
• Nachgewiesene Erfahrung in der Analyse von Next-Generation-Sequencing (NGS)-Daten
• Praktische Erfahrung mit mindestens einigen der folgenden Bereiche:
• Einzelzell-Transkriptomik
• Epigenomik (ATAC-seq, CUT&RUN, ChIP-seq)
• Räumliche Transkriptomik oder Multiomik
• Erfahrung in der Arbeit mit großflächigen Datensätzen und High-Performance-Computing-Umgebungen
• Vertrautheit mit statistischen Methoden zur Analyse hochdimensionaler Daten
• Kenntnisse in Techniken zur Datenintegration über mehrere Modalitäten hinweg
• Starke Problemlösungsfähigkeiten und die Fähigkeit, unabhängig zu arbeiten

Wünschenswerte Fähigkeiten

• Erfahrung in der Arbeit mit klinischen oder patientenbezogenen Datensätzen
• Kenntnisse in Rheumatologie oder Immunologie
• Erfahrung in Machine Learning oder KI-Ansätzen für biologische Daten
• Vertrautheit mit Workflow-Management-Systemen (z. B. Snakemake, Nextflow)
• Erfahrung mit Cloud-Computing-Plattformen

Was wir bieten

• Gelegenheit, an wirkungsvoller, translationaler Forschung zu arbeiten
• Zugang zu modernsten Technologien und Datensätzen
• Kollaboratives und interdisziplinäres Forschungsumfeld
• Möglichkeiten zur Karriereentwicklung und Weiterbildung